Пацієнту потрібно зняти з себе металеві предмети (прикраси, окуляри, слухові апарати) перед комп'ютерною томографією зубів, оскільки метал може зіпсувати результати. Після цього лікар або асистент лікаря налаштовує обладнання під індивідуальні параметри. Пацієнту потрібно залишатися нерухомим під час сканування, щоб отримати чітке та точне зображення.
Для комп'ютерної томографії стоматологія використовує апарат, який обертається довкола голови, роблячи серію знімків із різних кутів. Отримані результати обробляються створення тривимірного зображення кісток щелепи і м'яких тканин. Процедура займає лише 5-10 хвилин, і пацієнт не відчуває болю чи дискомфорту.